生信星球学习day6-毽子
新手攻略:
(1)R的赋值符号不是等号,而是<-
(2)在Console 控制台输入命令,相当于Linux的命令行
(3)R的代码都是带括号的,括号必须是英文的。
(4)显示工作路径 getwd()
(5)向量是由元素组成的,元素可以是数字或者字符串。
(6)表格在R语言中改名叫数据框^_^
(7)别只复制代码,要理解其中的命令、函数的意思。函数或者命令不会用时,除了百度/谷歌搜索以外,用这个命令查看帮助:?read.table
,调出对应的帮助文档,翻到example部分研究一下。
(8)数据类型(重点只有两个,剩下的不看)
--生信星球
part1:向量
元素包括:数字或者字符串(用chr表示)等
标量:一个元素组成的变量
向量:多个元素组成的变量
赋值
x<- c(1,2,3) #常用的向量写法,意为将x定义为由元素1,2,3组成的向量。
x
x<- 1:10 #从1-10之间所有的整数
x
x<- seq(1,10,by = 0.5) #1-10之间每隔0.5取一个数(注意是逗号不是分号)
x
x<- rep(1:3,times=2) #1-3 重复2次
x
提取元素
按照位置选取
#这里的x是你刚才赋值的变量名,根据自己的情况来修改
x[4] #x第4个元素
x[-4]#排除法,除了第4个元素之外剩余的元素
x[2:4]#第2到4个元素
x[-(2:4)]#除了第2-4个元素
x[c(1,5)] #第1个和第5个元素
(2)根据逻辑值
x[x==10]#等于10的元素
x[x<0]
x[x %in% c(1,2,5)]#存在于向量c(1,2,5)中的元素
Part2:数据框
1.创建doudou.txt
2建立示例数据:
X1,X2
A,1
B,
C,
D,3
E,
3.将示例数据放在你的工作目录下(!!!重要)
记得一定要放在工作目录里,否则报错。
用以下命令即可获得示例数据框:
X<-read.csv('doudou.txt')
(1)读取本地数据
(2)设置行名和列名
X<-read.csv('doudou.txt') #在示例数据里有doudou.txt 注意这里的变量X是一个数据框
colnames(X) #查看列名
rownames(X) #查看行名,默认值的行名就是行号,1.2.3.4...
colnames(X)[1]<-"bioplanet"#有的公司返回数据,左上角第一格为空,R会自动补为x,用这个命令来修改
X<-read.csv(file = "huahua.txt",sep = " ",header =T,row.names=1)#最后row.names的意思是修改第一列为行名
ps:(其实我们这个数据框并不需要改,如果你已经改了,知道怎么撤销吗?用刚才的read.table命令重新赋值一遍就可以覆盖掉你刚才改瞎的了。这也就是变量为什么叫"变"量)
嗯。我故意写了个大写的X,就是告诉你一下大小写是严格区分的,耶。
3)数据框的导出
write.table(X,file = "yu.txt",sep = ",",quote=F)#分隔符改为逗号,字符串不加双引号(默认格式带由双引号)
(4)变量的保存与重新加载
#这次没有处理完的数据下次想接着用怎么办?--学会保存和重新加载。保存的格式是RData。
save.image(file="bioinfoplanet.RData")#保存当前所有变量
save(X,file="test.RData")#保存其中一个变量
load("test.RData")#再次使用RData时的加载命令
(5)提取元素
- X[x,y]#第x行第y列
- X[x,]#第x行
- X[,y]#第y列
- X[y] #也是第y列
- X[a:b]#第a列到第b列
- X[c(a,b)]#第a列和第b列
- X$列名#也可以提取列(优秀写法,而且这个命令还优秀到不用写括号的地步,并且支持Tab自动补全哦,不过只能提取一列)
(6)直接使用数据框中的变量
新建一个脚本
plot(iris$Sepal.Length,iris$Sepal.Width)
把此代码复制进去
保存.(后缀为.R)
save(X,file="test.RData")这句代码如果报错object X not found,是为什么,应该怎么解决?
重新给X赋值?
或者判断x的大小写
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