『热门研究与论文发表系列研讨会』<第五期>回顾:Wiley + 单细胞研究
2022『热门研究与论文发表系列研讨会』开讲啦!
5月26日 <第5讲>上线
Wiley
主题
让特刊助力您的科研之路
嘉宾
张冰,Wiley期刊内容发展编辑。
现场Q&A
Q:特刊和专刊有什么不同?
A:我觉得不同出版社可能解读不同,对于Wiley期刊来说并没有一个特别大的区别,特刊(Special Issue)也可以叫做专刊。Special Issue可以代替正常期刊的某一期,这一期都会是统一主题。
Q:如何利用特刊获取学术前沿研究?
A:从读者的角度,建议通过Wiley的各个公众号,浏览特刊征稿、特刊荐读等类型的推文;也建议大家阅读特刊Editorial这个部分,在Editorial中编辑会对整个特刊的稿件进行的梳理,对特刊涉及的研究主题进行总结和展望;此外,还建议通过阅读特刊中的综述文章,快速获取这个研究主题的信息。
Q:老师好!想问问对有争议的文章,客编怎样处理呢?
A:对于大多数期刊,稿件的第一次评审会需要两到三份评审意见,如果这些评审意见中有较大差异,首先客编会结合自己对稿件的判断来决定最终意见。如果不能决定,有可能会再邀请一到两位评审人重点对争议的部分进行评审。
单细胞研究
主题
单细胞测序与大规模细胞组学研究
嘉宾
刘传宇,博士,现任深圳华大生命科学研究院单细胞组学项目负责人。
现场Q&A
Q:C4已经可以做单细胞多组学研究了吗?有没有相应的产品推出呢?
A:单细胞多组学研究技术我们研发团队已经完成了技术攻关,进入产品阶段我们还需要大规模不同类型样本的测试,我们希望在今年年底可以推出供大家使用。
Q:请教一下,跟常规的单细胞测序分析相比,大规模细胞组学研究的分析难点是什么?
A:举个例子来说明,使用同样的工具分析1W个细胞和分析100W个细胞,随之而来的问题是分析速度,即如何在短时间内拿到分析结果。在我看来,当前的一个难点是分析速度的问题,目前大多数分析工具适用的细胞量大概是10W~100W的规模,而目前一些项目的细胞量已经达到100W~300W。除此之外,就是大规模数据量的存储问题了。
Q:您刚刚提到猕猴单细胞图谱的研究,正常猴的组织怎么取得?
A:我们是通过与灵长类动物实验中心合作的模式获取到模式猴的生物样本,由专业的老师进行解剖与采样。
Q:单细胞在梨的果实上的发育研究应用建议?
A:做这个课题建议考虑两个点:1. 梨的发育过程中哪些时间点尤其重要,或者说是具有代表性的;2. 在这个代表性时间点下的样本是否容易获取(需要考虑细胞解离难度等问题)。
Q:空间转录组一定要跟单细胞结合才能分析吗?
A:不一定。目前会把空间转录组与单细胞结合分析是因为当前的空间转录组技术虽然可以比较好地完成细胞定位,但是对于转录组信息的捕获能力有待提升,即单个细胞分辨率下的基因捕获量还无法达到单细胞技术的基因捕获能力,需要辅助单细胞技术得到更多的基因信息。后续随着空间转录组技术的提升(例如基因数提升10倍),可能就不需要补充单细胞测序的信息了。
Q:C4对细胞直径有什么要求吗?对细胞质量的要求呢?
A:细胞直径不大于40μm;细胞活性在80%以上。
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