[JCIM | 论文简读] 基于结构鉴定萘醌及其衍生物是否可以作为SARS-CoV-2主蛋白酶和木瓜样蛋白酶的新型抑制剂

简读分享 | 庞超 编辑 | 李仲深

论文题目

Structure-Based Identification of Naphthoquinones and Derivatives as Novel Inhibitors of Main Protease Mpro and Papain-like Protease PLpro of SARS-CoV-2

论文摘要

由冠状病毒 SARS-CoV-2 引起的全球 COVID-19 大流行导致人们迫切需要新的抗病毒药物。主蛋白酶 (Mpro) 和木瓜样蛋白酶 (PLpro) 在冠状病毒中是重要的药物靶标，因为它们在加工从病毒RNA翻译的多种蛋白中起重要作用。在这项研究中，作者针对 SARS-CoV-2 的 Mpro 筛选了 688 种萘醌化合物和衍生物。使用新型荧光底物在针对 Mpro 的生化测定中选择并评估了 24 种衍生物。四种化合物抑制 Mpro 的半数最大抑制浓度 (IC50) 值介于 0.41 μM 和 9.0 μM 之间。此外，三种化合物抑制 PLpro 的 IC50 范围为 1.9 μM 至 3.3 μM。为了验证 Mpro 和 PLpro 抑制剂的特异性，作者的实验包括了假阳性的常见原因，例如聚集、高复合荧光和酶氧化抑制。作者基于结构的计算和生化方法确定了新型萘醌骨架可以作为 SARS-CoV-2 抗病毒药物进一步探索。

论文链接

https://pubs.acs.org/doi/10.1021/acs.jcim.2c00693