Linux上安装BLAST:快速、容易、便捷(Linux安装blast)
2023-06-13 09:14:10 时间
Linux上安装BLAST:快速、容易、便捷
BLAST(快速最佳搜索工具)是一款用于生物序列比对的非常有用的应用程序。安装BLAST有助于用户更加快速、容易、便捷地访问和比较生物信息。它可以帮助用户以更快的速度找到某一特定序列,从而发现分析DNA、RNA和蛋白质等生物学数据,简化了分析流程并加快分析结果的获得。
在Linux上安装BLAST过程非常简单,不需要复杂的设置,只需要下载并安装BLAST的源代码即可;基本的安装过程可以简单概括如下:
1.下载BLAST源代码:
wget http://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/blast/executables/blast+/2.10.0/ncbi-blast-2.10.0+-src.tar.gz
2.解压源代码:
tar -zxvf ncbi-blast-2.10.0+-src.tar.gz
3.进入解压后的路径:
cd ncbi-blast-2.10.0+-src
4.编译:
./configure
make
make install
完成后,只需在终端中输入以下命令即可打开BLAST:
`bash
blastn -help
安装完成后,建议用户配置一个blast运行环境,让它可以从任何路径访问,可以在~/.bashrc文件中加入一行:
```bashexport PATH=$PATH:/usr/local/ncbi/blast/bin
上面的步骤可以让用户在Linux上更加快速、容易、便捷地安装BLAST,Linux上BLAST应用也会变得更加便捷,同时也有助于用户发现并分析生物学信息。
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服务方式:远程服务、电话支持、现场服务,沟通指定方式服务
技术标签:数据恢复、安装配置、数据迁移、集群容灾、异常处理、其它问题
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