R包的安装
2023-06-13 09:17:24 时间
一、函数:小括号前面有英文单词就是函数
1、函数的元素:函数名及参数,其中参数包括实际参数、形式参数
2、新建函数的函数:使用function函数来建立新的函数
当一个代码需要复制粘贴3次,就应该写成函数或使用循环
3、默认参数
作者可以为参数设置默认值,不是所有的参数都要出现在代码里,没有出现的是默认值
二、R包
1、定义:多个函数打包存放的“容器”,包括函数、数据、帮助文件、描述文件等。
2、作用:实现特定的功能,你需要什么功能,安装相应的R包就行。说人话就是使用智能手机,需要使用微信与人聊天,你就按照微信APP,需要上腾讯视频看电视剧,你就安装腾讯视频APP。
3、在哪可以找R包:
(1)官方网站CRAN网站下载,使用“install.packages()”函数来安装
(2)Bioconductor网站下载,主要是生物生信相关的R包,使用 “BiocManager::install()来安装
(3)github网站,是R包作者写的,没有经过审核,使用”devtools::install_github()来安装。几乎不使用,使用时需要写明R包的作者,就是指明选择谁写的R包。
4、如何安装
安装如上
安装后需加载才能使用,加载的函数“library()”,“require()”
一次安装,每次打开新的窗口时(重启Rstudio)都需要加载。说人话,智能手机安装的腾讯视频,只要你不卸载,就一直在你的手机里,需要看电视剧是打开APP,看完电视了你退出APP,再次看电视时还需要再次打开APP。所有“加载”R包就相当于打开APP。
5、如何实现快速下载
如果官网速度慢,请使用镜像网站
官方网站CRAN网站的镜像使用方法1,Bioconductor网站的镜像使用方法2,方法2也适用CRAN
三、安装R包会遇到问题,要学会解决问题
以上图片均引用生信技能树数据挖掘课程小洁老师的课件。
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