新手的小本本：

（1）R的赋值符号不是等号，而是<-

（2）在Console 控制台输入命令，相当于Linux的命令行

（3）R的代码都是带括号的，括号必须是英文的。

（4）显示工作路径 getwd()

（5）向量是由元素组成的，元素可以是数字或者字符串。

（6）表格在R语言中改名叫数据框^_^

（7）别只复制代码，要理解其中的命令、函数的意思。函数或者命令不会用时，除了百度/谷歌搜索以外，用这个命令查看帮助：?read.table，调出对应的帮助文档，翻到example部分研究一下。

（8）数据类型（五种，重点只有两个，剩下的不看）

向量（vector）?重要

矩阵（Matrix）

数组（Array）

数据框（Data frame）?重要

List

一、读取本地数据

正确代码："\t"中的""内不能有任何空格，否则会导致下图中的报错

read.table(file="doudou.txt",sep = "\t",header = T)

补充：

read.table()函数可以将1个或多个空格、tab制表符、换行符或回车符作为分隔符。而sep分开数据的分隔符。默认sep=""。

header=T是header=TRUE的缩写，header是一个逻辑值，指示表格是否包含文件第一行中的变量名称

二、设置行名和列名

X<-read.csv('doudou.txt') #在示例数据里有doudou.txt 注意这里的变量X是一个数据框
colnames(X) #查看列名
rownames(X) #查看行名,默认值的行名就是行号，1.2.3.4...
colnames(X)[1]<-"bioplanet"#将第一列列名改为bioplant
colnames(X)[1]<-"bioplanet"#将第一行行名改为bioplant
X<-read.csv(file = "huahua.txt",sep = "	",header =T,row.names=1)

三、导出数据框

write.table(X,file = "yu.txt",sep = ",",quote=F)#分隔符改为逗号，字符串不加双引号（默认格式带由双引号）

四、变量的保存与重新加载

如果这次没有处理完的数据下次想接着用怎么办?

方法是--学会保存和重新加载。`保存的格式是RData。

save.image(file="bio.RData")#保存当前所有变量，RData的名字是bio

save(X,file="test.RData")#保存X这个变量，RData名字是test

load("test.RData")#再次使用RData时的加载命令```

五、提取元素

- X[x,y]#提取X变量的第x行第y列的元素
- X[x,]#提取第x行的元素
- X[,y]#提取第y列的元素
- X[y] #提取第y列的元素
- X[a:b]#第a列到第b列的元素
- X[c(a,b)]#第a列和第b列的元素
- X$列名#也可以提取列（支持Tab自动补全，不过只能提取一列）

课后问题：

save(X,file="test.RData")这句代码如果报错object X not found，是为什么，应该怎么解决？

这句代码的意思是保存变量X在特定文件test.RData中，会出现问题中的报错情况是因为还没有定义X这个变量又或者说没有这个变量存在，解决方法可以将需要保存的数据赋值到X这个变量或者将X改为已经定义的变量

以上代码以及新手小本本均来自生信星球