【画图】如何对clusterProfiler富集结果进行筛选并画图?
如何 进行 结果 筛选 画图 富集 clusterProfiler
2023-06-13 09:15:24 时间
前言
Y叔神包(clusterProfiler)[1],用起来是真的很舒服。注释基因功能,看看有啥通路全靠他。做好富集以后,一个简单的代码,整体的结果即刻展现。比如下面这个图,
那么如何挑选其中一个节点或者几个节点展示呢?比如挑选其中的lymphocyte chemotaxis和secondary alcohol metabolic process展示
Y叔的Github里面和原来的教程中有个包是clusterProfiler.dplyr,可以进行筛选操作,不过最近Y叔在更新,这个包暂时没有了。有的小伙伴还想对富集结果进行筛选怎么办呢?
画图代码如下
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