[JCIM | 论文简读] Chemspace Atlas:用于药物发现的多尺度大型化学数据库
2023-02-18 16:48:02 时间
简读分享 | 庞超 编辑 | 李仲深
论文题目
Chemspace Atlas: Multiscale Chemography of Ultralarge Libraries for Drug Discovery
论文摘要
如今,药物的发现不可避免地要使用包含大量化合物的数据库。了解它们的化学组成和物理化学性质对于靶点识别至关重要。高效的多功能工具可以对不断增长的化学库进行多方面分析,但它们必须配合大量数据使用。在这里,作者公开了可以免费访问的Chemspace Atlas,其中包括近4万个分层次的生成式拓扑映射(GTM),可容纳多达5亿的化合物,包括类片段、类先导化合物、类药物、类PPI和类NP的化学子空间。它们允许用户从不同尺度上的多个角度寻找和分析ZINC、ChEMBL和COCONUT:从整个数据库的总览到小集群中的结构模式检测。大约有20种物理化学性质和近750种生物活性可被可视化,支持活性图谱分析和模拟搜索。此外,Chemspace Atlas以后将扩展新的化学子空间(如DNA编码文库和合成子)和官能团。
论文链接
https://pubs.acs.org/doi/10.1021/acs.jcim.2c00509
数据库链接
https://chematlas.chimie.unistra.fr
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