学习小组Day3笔记--刘
软件下载器
日常中就可以用MINICONDA
下载MINICONDA
途径: MINICONDA 清华
下载最新的版本,还需注意系统是64还是32,用uname -a看
打开下载页面,右键点击复制下载链接
wget 刚才你复制的下载链接,如下图
「for Windows」请记住这里的粘贴不是ctrl+c和ctrl+V了,选中,鼠标左键点一下是复制,右键点一下是粘贴;
sh是脚本(就是一个程序,后台的代码)文件的后缀,也就是说其实这是一个下载的脚本,如果你安装失败了,这个脚本是不需要重新下载的,还是可以用的。
安装
bash Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh
激活 很重要!!!
source ~/.bashrc
来激活conda
命令行输入conda,出现满屏的信息说明成功了
# 添加镜像
`
使用中科大的镜像
conda config --add channels https://mirrors.bfsu.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda/
conda config --add channels https://mirrors.bfsu.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge/
conda config --add channels https://mirrors.bfsu.edu.cn/anaconda/pkgs/free/
conda config --add channels https://mirrors.bfsu.edu.cn/anaconda/pkgs/main/
conda config --set show_channel_urls yes
开始使用CONDA
conda list
查看当前服务器上安装的所有软件列表
安装软件
conda install fastqc -y
【-y是yes,安装过程中conda问你的问题全部回答yes,你可以试试不加-y有什么区别】
fastqc --help
帮助文档,也可以确定软件安装成功
卸载软件
conda remove fastqc -y
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