生信星球学习小组-Day1学习笔记--编写Markdown格式的笔记
2023-03-07 09:02:51 时间
? 有幸参加生信星球的学习小组,非常感谢 花花、豆豆老师提供的平台。 ?
illumina测序原理概述
illumina是当前最热门的二代测序公司,它的测序特点是使用具有叠氮基和荧光标记的dNTP边合成边测序。
由于dNTP上叠氮基的存在,每个测序循环只能延伸一个碱基,由于四种碱基所携带的荧光基团各不相同,因此分析每个循环读取到的荧光类型就可以得知对应的碱基类型,重复这个过程,就可以完成所有碱基序列就测定。
illumina测序的工作流程
建库->桥式PCR扩增成簇->测序
- 基本概念介绍:
flowcell(流动池):illumina测序仪中实际进行的测序反应位于flowcell(流动池)中,一个flowcell有8条lane(通道),每个lane内表面大量共价结合了两种短序列,这两种短序列将会用于结合构建好的文库片段。
1.建库
使用超声波将DNA样品随机打碎成小片段,接着使用T4酶修补成平末端,再使用 klenow酶在3’末端加上一个特异的碱基A,最后为这些DNA片段添加特定的接头序列(adapter)。
接头序列一般包含三部分:
sequencing binding site(绿) index(红,黄) 与流动池中的短序列互补的序列(蓝,紫)
……
以上内容源自以下文章,后续步骤原理跳转学习即可。 生信菜鸟团-illumina测序的化学原理 知乎-illumina 测序原理介绍 知乎-二代测序原理(Illumina)
相关文章
- 发现 Linux SpaceFM 文件管理器的威力
- 夯实数据智能底座 共筑数字经济发展“新基石”
- 五分钟教你使用console.log发布公司的招聘信息
- 微软发布 Windows 11 Beta 预览版 Build 22621.1250 和 22623.1250 (KB5023008)
- Windows 11 学院:在 Windows 11 Build 25290 上如何为文件管理器启用标签页拖拽支持
- 微软Windows 11 Dev 预览版 Build 25290 发布:带来新的开始菜单提醒角标
- 微软正用全屏通知提醒 Windows 10 用户免费升级 Windows 11,要点击 5 次才能退出
- Linux Mint 21.2 将于 6 月发布:改进登录屏幕,优化 Pix 图像管理程序等等
- 字节面试也会问SPI机制?
- 微软正式停售 Windows 10 产品密钥 / 许可证:继续提供 ISO 镜像下载,推荐用户升级 Windows 11
- 用复古电脑程序 Toy CPU 学习低级编程
- Windows 11 新功能泄露:现代音量合成器、实验工具和新的文件管理器
- 微软 Windows 11 文件资源管理器全新设计曝光:UI 迎来大修,整合 Microsoft 365
- 对比Pandas,学习PySpark大数据处理
- 微软宣布为Windows 11 21H2设备开启自动更新到22H2版本
- 互联网都在说降本增效,小红书技术团队是怎么做的?
- 微软将继续提供 Windows 10 ISO 镜像下载,即将停售产品密钥 / 许可证
- 微软宣布为Windows 11 21H2 设备开启自动更新到 22H2 版本
- 面试突击:Properties和Yml有什么区别?
- 微软 Windows 11 Beta 预览版 22621.1245 和 22623.1245 (KB5022358) 发布