代谢组学服务找CRO公司关键点竟然在这里
组学服务商涉及方面太多,既包含CRO公司品牌、商誉、组织人才、实施案例、客户口碑、公司大小,还包含技术细节、设备实力、人才能力、数据处理能力、服务效率、服务人员是否经验丰富、数据库量和质,此外,还有自己的资金支持、重视程度、目标层次不同等自身需求原因,选择哪个公司作为服务商,好比投资公司一样复杂。
代谢组学又包含样本前处理、数据获取、峰检测、峰对齐、差异特征筛选、化合物鉴定、二级谱验证、定量检测等流程,其中除了实验标准,质量把控要严格外,一直被大家疏忽的还有数据处理部分,生物质谱数据非常复杂,人体正常代谢物就有上万种,如果检测信号不准确,批次效应无法对齐,不同方法得到的实验结果完全是不一样的。
上面实验时我用相同数据,采用不同软件得到的PLSDA结果图,可以看到左边图完全分不开,右侧图能够清晰分开,可以看出不同峰检测算法对于信号的检测对比差异非常明显。所以,我们需要把控实验前处理质量和方法的同时,还需要考察CRO公司的数据处理能力。
在技术飞速发展的代谢组学研究领域,精准和高通量正成为引领发展的方向。对于代谢组学服务,组学服务公司摩赛恩在数据处理部分有独特优势,摩赛恩科技聚焦分子智能识别检测技术,开发自主知识产权核心算法,提供专业化组学和质谱数据处理、挖掘服务,满足生物医药、食品等行业质谱用户个性化分子智能识别需求。
摩赛恩有自研的峰检测、峰对齐技术,基于深度学习训练的识别模型,处理效果特别好,有效解决了代谢组学分析的核心痛点和难题,还有自建数据库和主流数据库(Pubchem、MoNa、HMDB、NIST、MassBank等)进行快速化合物鉴定。
对于代谢组学研究中发现未知分子,有无自建的谱图数据库和高精度的智能峰检测算法,这个大部分科研学者在找CRO服务的时候都容易忽视,不同数据处理方法对于组学研究结果是天差地别的,而目前质谱仪器越来越灵敏,前处理也在不断标准化,而数据处理部分现在才是最关键的因素,就需要找到数据处理和数据库定性能力强的服务公司。
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