CCLE数据库也单细胞转录组数据啦
2023-03-15 23:22:28 时间
文章标题是:《Pan-cancer single-cell RNA-seq identifies recurring programs of cellular heterogeneity》,链接是 https://www.nature.com/articles/s41588-020-00726-6 值得细读!
这个研究数据整理的非常好,可以下载的数据真多:https://singlecell.broadinstitute.org/single_cell/study/SCP542/pan-cancer-cell-line-heterogeneity#study-download
重要的应该是下面的文件 :
CCLE_scRNAseq_github.zip
CPM_data.txt CPM - post-QC human
Metadata.txt
UMIcount_data.txt
还有区分了各个细胞系的文件:
tSNE_Bile_Duct_Cancer.txt (tSNE Bile Duct Cancer)
tSNE_Bladder_Cancer.txt (tSNE Bladder Cancer)
tSNE_Bone_Cancer.txt (tSNE Bone Cancer)
tSNE_Brain_Cancer.txt (tSNE Brain Cancer)
tSNE_Breast_Cancer.txt (tSNE Breast Cancer)
tSNE_Colon_Colorectal_Cancer.txt (tSNE Colon Colorectal Cancer)
tSNE_Endometrial_Uterine_Cancer.txt (tSNE Endometrial Uterine Cancer)
tSNE_Esophageal_Cancer.txt (tSNE Esophageal Cancer)
tSNE_Fibroblast.txt (tSNE Fibroblast)
tSNE_Gallbladder_Cancer.txt (tSNE Gallbladder Cancer)
tSNE_Gastric_Cancer.txt (tSNE Gastric Cancer)
tSNE_Head_and_Neck_Cancer.txt (tSNE Head and Neck Cancer)
tSNE_Kidney_Cancer.txt (tSNE Kidney Cancer)
tSNE_Liver_Cancer.txt (tSNE Liver Cancer)
tSNE_Lung_Cancer.txt (tSNE Lung Cancer)
tSNE_Neuroblastoma.txt (tSNE Neuroblastoma)
tSNE_Ovarian_Cancer.txt (tSNE Ovarian Cancer)
tSNE_Pancreatic_Cancer.txt (tSNE Pancreatic Cancer)
tSNE_Prostate_Cancer.txt (tSNE Prostate Cancer)
tSNE_Sarcoma.txt (tSNE Sarcoma)
tSNE_Skin_Cancer.txt (tSNE Skin Cancer)
tSNE_Thyroid_Cancer.txt (tSNE Thyroid Cancer)
相关文章
- 从本体论开始说起——运营商关系图谱的构建及应用
- 如何成为一名数据科学家?
- 从未见过的堂兄杀了人,你的DNA是关键证据
- 20个安全可靠的免费数据源,各领域数据任你挑
- 20个安全可靠的免费数据源,各领域数据任你挑
- 阿里云李飞飞:All in Cloud时代,云原生数据库优势明显
- 基于Hadoop生态系统的一高性能数据存储格式CarbonData(性能篇)
- 大数据告诉你:10年漫威,到底有多少角色
- TigerGraph:实时图数据库助力金融风控升级
- Splunk利用Splunk Connected Experiences和Splunk Business Flow 扩大数据访问
- 大数据开发常见的9种数据分析手段
- 以免在景区看人,我爬了5W条全国景点门票数据...
- 【实战解析】基于HBase的大数据存储在京东的应用场景
- 数据科学家告诉你哪些计算机科学书籍是你应该看的
- Kafka作为大数据的核心技术,你了解多少?
- Spring Boot 整合 Redis 实现缓存操作
- 大数据学习必须掌握的五大核心技术有哪些?
- 基于Antlr在Apache Flink中实现监控规则DSL化的探索实践
- 甲骨文再次被Gartner评为分析型数据管理解决方案魔力象限领导者
- 爬取吴亦凡微博102118条转发数据,扒一扒流量的真假